O Conselho Geral é o órgão de direção estratégica responsável por linhas orientadoras da atividade da escola, assegurando a participação e representação da comunidade educativa.
Para além do Diretor, o Conselho Geral é composto por 21 Membros:
- 7 Representantes dos professores eleitos dos diferentes ciclos de ensino.
- 2 Representantes eleitos dos assistentes técnicos e operacionais.
- 2 Representantes dos alunos eleitos sendo do ensino secundário.
- 6 Representantes dos Pais e Encarregados de Educação, um por cada Associação Pais das 6 escolas do Agrupamento.
- 3 Representantes da Autarquia Câmara Municipal de Lisboa, tendo esta delegado competências de representação nas Juntas de Freguesia onde existem escolas do Agrupamento.
- 1 Membro cooptado representante da comunidade local.